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完成該完成的事情，小智就來到了正輝燈塔，小智先找到了之前的那一隻發育不良的大鉗蟹，直接用威力極小的波導彈打暈將其收服。
並且還在森林中訓練了自己的每一隻神奇寶貝，每一隻的實力都有極大的提升，只是比雕這小子又飄了，被集體揍了一頓又老實了下來，比雕這小子吃癟後想去欺負新收服的神奇寶貝的時候就被皮卡丘老老實實的教育了一頓。
小智想起了前世的石英聯盟，看了看手中裝有大鉗蟹的精靈球，想起他那一穿三的戰績，心中微微一嘆“你擁有超高的天賦，以及強大的戰鬥能力，而我卻把你放在了大木研究所讓明珠蒙塵，但是這一世我找到了你，我會讓你和我一起走向石英聯盟的巔峰”。
隨後來到了正輝燈塔的面前，看到了塔中的燈光一閃一閃的，小智直接來到了正輝燈塔的面前，敲響了房門只見這時穿著古代神奇寶貝的玩偶服的人出現。
他看見小智的時候，就立刻將自己身上的玩偶服脫了下來並且開口詢問道“請問你這是找誰？”。
小智也沒有隱瞞，直接回答道“我來找正輝博士”。
穿著玩偶服的那人開口對小智笑道“我就是”。小智也做出了自我介紹“你好，我是來自真新鎮的小智，能否和你借個電話，打個電話給大木博士？”。
正輝聽到小智這樣回答，連忙點頭開口說道“好的，沒問題，說起來我還算是大木博士的學生呢”。
小智也是點了點頭，來到了電話亭這邊，直接拿起了電話給木木博士，撥打了過去。
只見兩人開始一陣寒暄過後，小智就開門見山的說道“大木博士，你幫我對聯盟申請一下解除六個精靈的限制，然後再給我幾顆大師球或者是高階球”。
大木博士看著小智一臉認真的樣子，驚訝的開口道“六個精靈的限制，我可以幫你解除，但是你要大師球和高階球做什麼？。”
小智並沒有回答，只是說了一句“我需要用你對聯盟申請一下”。
大木博士看到小智這個樣子，也是答應了下來。
之後，小智便對正輝博士明知故問的開口道“你這個神奇寶貝的叫聲翻譯是什麼？”。
正輝也是拍了拍自己的胸膛，對小智說道“這你可就問對人了，這個叫聲的含義就是你在哪裡，你在哪裡，我好想你”。
“而我所創造出來的聲音跟這個聲音的相似度可是接近了100，意思就是，我就在這裡，我也好想你，你在哪裡？”。
隨後小智隨後，小智給正輝博士簡單做了一頓飯，正輝博士看到這個樣子也非常的感謝小智，對著小智開口道“謝謝你做的晚餐，不然我都不知道我一整天都忙於研究，沒吃過飯這件事了。”
小智也是無語的，看著這個研究狂人，但是也沒過多理會就埋頭吃起了飯。
吃完飯的正輝拿出了一個盒子，上面正擺放著兩顆高階球和一顆大師球，對著小智說道“反正我留著也沒有用，送給你了”。
小智也沒有矯情便直接收了下來，而且還感謝了一下正輝博士。
隨後看見天空出現了巨大的迷霧，一隻巨大的神奇寶貝出現在了燈塔的上方，他看見是機器發出來的，聲音怒吼了一句，並且口中爆發出強大的破壞死光，將機器破壞掉還有正輝燈塔也破碎了，隨後，這隻巨大的神奇寶貝轉身飛向了遠方。
小智看到這一切，也是百感交集，心中卻是想到“如果有緣再見的話，我會把你送到快龍島，那裡才是你的歸宿”。
隨後，就與正輝博士告別，轉頭就離開了。
離開後的小智在心中盤點著今天的收穫，第一，解除了精靈球的限制。第二，獲得了一顆大師球，還有兩顆高階球，隨即露出了一笑容，但他的旅程還
