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三月三十一日，井川和巖畔在紐約會見了那兩個神父，井同兩個神父進入了正式談判。巖畔和井川說：&ldo;我們想，兩國談判要有一個基本條件，基督教的教義認為最大的罪惡是背離道德。作為日本來說，它與德意締結三國同盟尚為時不久，不能對此背信棄義，美國也不會強行要求日本退出三國同盟，因此，我們希望以此作為談判的前提。&rdo;由於這兩個神父對此表示了諒解，所以雙方決定對調整兩國關係的原則問題進行討論。
於是，井川和巖畔便前往華盛頓，向野村大使和若杉公使對此事作了匯報。野村和若杉雖然很感興趣，但似乎都有這種想法，認為形勢並不怎麼好，不宜馬上把一些條件定下來，因此，希望在五、六個月後，待日美兩國間的感情慢慢緩和下來時再舉行正式談判。
因為當時日美之間還沒有一個具體方案，所以井川和巖畔又於四月二日同華爾什神父等人舉行了會談，直到五日才擬訂出一個方案。日本方面也對此方案進行了研究，參加研究的，以野村大使為首，有若杉公使、陸軍武官磯田少將、海軍武官橫山大佐、書記官松平，還有井川和巖畔等七人。四月十五日搞出了初步方案，那就是《日美諒解方案》。
就這樣，過去以神父等人為媒介而訂出來的《日美諒解方案》，現在已經進入到了一個正式納入外交途徑的階段。
大發雷霆的松岡外相
當外務省接到野村拍來的有關《日美諒解方案》的內容以及要求答覆的電報時，松岡外相結束了歐洲之行，已乘坐蘇聯政府的&ldo;紅矢號&rdo;專車正在回國途中。因此，外務次官大橋在十八日上午十一時向正在召開內閣會議的近衛首相作了首次匯報。下午四時半譯好電文後，他馬上又去拜訪近衛。當晚八時，近衛首相召開政府和統帥部的聯絡會議，就《日美諒解方案》進行了討論。討論結果，決定待松岡外相回國後再決定應採取的態度，但不管怎麼說，由於這是一個&ldo;很好的方案&rdo;，因此已大體上傾向於準備接受。
在四月十八日的《種村日記》中這樣寫道：
&ldo;這一天，駐美武官礬田突然來電。內雲：&l;調整日美兩國外交關係問題可能達成協議，望政府速回電指示。&r;
&ldo;要同美國調整關係！這幾年來，不論是棘手的中國問題抑或最近出現的南方問題，我們總對美國的態度最感到擔心，如今卻要我國同美國調整關係！這到底是根據誰的命令開始舉行日美兩國之間這一談判的？
&ldo;就我們這些下級官員來說，這個問題簡直是晴天霹靂，而且事情又發生在松岡外相出訪歐洲至今尚未回國的時候，我覺得問題實在太嚴重了&rdo;
聯絡會議結束以後，陸海軍和外務省對《日美諒解方案》又進行了研究。關於當時的氣氛和結論性的傾向，內大臣木戶孝一在他的日記中這樣寫道：
&ldo;四月十九日星期六晴
&ldo;晚上八時二十分，近衛首相來訪。彼此以野村大使請求回電問題為中心，暢談到九時五十分左右。一致的結論是：對德意兩國不失信義；也不與我國建設大東亞共榮圈新秩序這一方針相牴觸；可以在充分研究的基礎上努力使之實現的。&rdo;
參謀本部從二十日傍晚開始召開各部長會議，會上，確定了這樣一種思想：&ldo;應在不違背三國同盟精神這個限度內調整對美關係&rdo;。
接著，第二天（二十一日）上午，陸軍省和參謀本部召開區域性長以上的幹部會議，對前一天晚上參謀本部的態度一致表示同意。隨後，當天下午召開了陸海軍部局長會議，又對野村大使的來電抱何種態度問題進行了協商。協商結果一致同意：
一、要
