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齊磊答道：&ldo;陛下，我們剛剛控制了港口，還沒有來得及清點港口中的船舶數量。&rdo;
林飛點點頭，說道：&ldo;那好，你們現在趕緊去清點吧，注意在清點的時候發動港口的華人幫忙。&rdo;
齊磊答應下來，接著問道：&ldo;陛下，我們控制住了一千餘名出逃的西班牙人，這些人怎麼處理？&rdo;
林飛問道：&ldo;這些人都是什麼人？&rdo;
齊磊答道：&ldo;從衣著上看，都是有錢人。&rdo;
林飛沉思片刻，說道：&ldo;把他們關押起來，以後讓西班牙政府拿黃金來換。&rdo;
齊磊答應下來，轉身走了，林飛隨後讓人去市政府，向城中百姓宣告了華夏帝國接管哥打巴託的事情，然後發動城中華人，組織各種各樣的機構，包括城衛隊，哥打巴託的華人比例高達百分之五十，所以後續的工作比武端城順利得多。
林飛率領總參謀部住進了總督府，把這裡當成了臨時辦公地點，兩天之後局勢安定，林飛心想，現在軍隊的規模逐步擴大，是時候加強軍隊的政治建設了。
林飛在各個連隊設立了&ldo;政治指導員&rdo;一職，選拔有文化的戰士擔任，並把這些政治指導員集中到一起進行培訓，培訓的內容主要是豎立林飛的個人權威、強調解放華人的重要意義、熱愛華夏帝國等等。
林飛加強思想政治工作也是要把軍隊牢牢地掌握在自己手中，雖然說這支軍隊是由自己一手創立的，軍中骨幹也都是自己的親信，可是隨著軍隊規模的擴大，難免有人起私心，一但有人背叛自己，對自己的打擊將是非常致命的。
林飛又把各部隊主官召集起來，說道：&ldo;這次哥打巴託戰役，我軍出動了兩個團的兵力，經過了三天的激戰，攻克哥打巴託，擊斃守軍1589人，俘虜守軍1856人，全殲了守軍主力！&rdo;
&ldo;這場戰役分為兩個階段，第一階段，我軍用&l;疲兵之計&r;，轉移敵軍注意力，由工兵連開掘地道，抵近哥打巴託城牆；第二階段，我軍炸開城牆，攻入城中進行巷戰，在這兩個階段的戰役中，我軍湧現出了一批先進集體和個人，現在，我要對他們進行嘉獎。&rdo;
眾人聽見&ldo;嘉獎&rdo;這個詞都覺得新鮮，這些人一部分是從清廷軍隊中出來的，一部分原本是老百姓，沒怎麼聽說過&ldo;嘉獎&rdo;這個詞。
林飛朗聲說道：&ldo;我首先要嘉獎的就是‐‐&rdo;林飛說到這裡語氣一頓，拉長聲音說道：&ldo;工兵連！&rdo;
工兵連連長秦喜仁站起身來，高聲答道：&ldo;到！&rdo;
林飛說道：&ldo;這場戰役的勝利，首先應該歸功於工兵連，如果沒有工兵連炸開城牆，我軍就不可能攻入城中，所以這第一份嘉獎令，應該授予工兵連。&rdo;
林飛回頭對李天仟說道：&ldo;把我做的旗幟拿過來。&rdo;
李天仟隨即拿來一面鮮紅的大旗，遞到林飛面前，林飛把旗面展開，只見上面寫著五個大字‐‐首功工兵連！
林飛把大旗遞給秦喜仁，高聲說道：&ldo;秦連長，這面旗以後就是你們的連旗，希望你部珍惜這份榮譽，以後再立新功。&rdo;
林飛給李天仟使了個眼色，李天仟帶頭鼓起掌來，眾人也都跟著鼓掌，秦喜仁激動地接過連旗，熱淚盈眶，一句話都說不出。
林飛讓秦喜仁坐下，接著又讓李天仟拿來一面紅旗，旗面沒有展開，眾人都在想著，這面旗是給誰的？林飛沒有展開旗面，而
