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地中海貧血的根本原因在於先天遺傳性基因缺陷。人體中血紅蛋白的重要成分是珠蛋白，而珠蛋白的合成由基因決定，當珠蛋白基因出現缺失、點突變等異常情況時，就會導致珠蛋白生成障礙，進而引發地中海貧血。
比如，α 珠蛋白生成障礙性貧血就是因為 α- 珠蛋白基因的缺失或者點突變，使得 α 肽鏈合成出現障礙而發病；β 珠蛋白生成障礙性貧血則是編碼 β- 珠蛋白基因發生缺失或突變，造成 β 肽鏈合成受阻，最終引發疾病。患者從雙親那裡遺傳了有缺陷的基因，這些存在問題的基因遺傳到下一代，便使得下一代具備了患地中海貧血的內在因素，在一定條件下就可能發病，讓機體呈現出貧血以及其他相關的病理狀態。而且由於基因缺陷的複雜性與多樣性，缺乏珠蛋白鏈的型別、數量不同，其臨床症狀也存在較大的變異性。
（二）高發地區及相關因素
地中海貧血在全球的分佈呈現一定的地域性特點，主要高發於熱帶和亞熱帶地區，像地中海沿岸、非洲大部分地區、中東、印度、次大陸、中國南方、東南亞，乃至印度尼西亞和太平洋地區，另外，美國、中美和南美等國因為移民因素也成為了高發區。在我國，長江流域以南的各省，如廣西、廣東、海南、四川、貴州、香港和臺灣等地是高發區，其中廣西、廣東、海南的發病率尤其高。
在這些高發地區，倘若人們沒有做好婚前遺傳諮詢以及婚前檢查、產前檢查及產前診斷等相關措施，孕育的孩子就更容易患上地中海貧血。因為在未進行相關檢查和諮詢的情況下，夫妻雙方很可能都攜帶地中海貧血的突變及缺陷基因卻不自知，他們結合生育時，就有較大機率將有缺陷的基因同時傳遞給孩子，當孩子從父母雙方繼承到的相關隱性致病基因湊齊時，便會發病。所以，建議高發地區人群務必重視並完善婚前檢查、產前檢查等環節，做好疾病的預防，減少地中海貧血患兒的出生。
：()那年那時的青春
