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經過一番討論與醞釀之後，曾紀澤下詔對中央政府革，廢原先的六部制，改為內閣制，政府最高行政機構為國務院，下設內務部、財政部、外交部、陸軍部、海軍部、司法部、教育部、交通部、工商部、農林部、科技部、警備部十二個部門，各設總長一名，副總長兩名，分管諸項事務。國務院設國務總理一名，統領國務院諸部，並直接受皇帝之領導。
同時，各地方政府也將仿效中央政府，改府為市，改衙門為政府，地方政府的行政設定，同樣仿效中央，但級別要依次下降，如省一級財政部門稱為財政廳、市一省稱為財政司、縣一級稱為財政處。
為防止地方政府臃腫龐大，並限制其權力，省市一級將不設外交、陸軍、海軍三部門，縣一級將不設外交、陸軍、海軍、科技四部門。同時，各級的司法部門將不受本級最高行政長官的領導，直接由中央逐級任免。至於縣以下的行政，則暫時推行鄉村自治，縣長領導的模式。
曾紀澤對政府機構進行大刀闊斧的改革，無非是想盡快營造出一個現代化的國家行政模式，只有這樣，才能更好的匹配新一輪的維新變革。
在改組完政府機構之後，曾紀澤馬上對經濟進行了改革，除了繼續推進正在進行的“土地改革”之外，曾紀澤首先對地稅進行了改革。
十二月初，大明政府釋出了《地稅改革條例》定以耕地的法定價格作為全國統一的課稅標準；國稅的稅率定為法定地價的3另加10％的附加稅；地稅一律用貨幣繳納；法定納稅人是從國家領取土地執照而擁有土地所有權者。
人均十畝及以下者，按以稅率收稅，十畝以上者，每增加五畝稅率遞增百分之1％，附加稅遞增033％。
與這項措施時拖出的，但凡願向政府出售多餘土地者，政府將以原先地價的三倍補償。另外一種方法就是國家以投資貸款的形式收購土地，售出者所得資金，必須用於投資興辦各種新興洋務商業，並且將獲得為期三年的低稅待遇。
這兩項措施的配套除了扼止並削弱地主的發展，還能鼓勵民間資本投向洋務行業，但最重要的是，透過地稅改革國家將從富有的地主們手裡獲得鉅額的財富，而這些財富是曾紀澤殖產興業運動的重要保障。
很快，曾紀澤便透過國務院下達了“殖產興業”的全國性政策，政府將引導、倡導、鼓勵和獎勵大明各階層人士來投資產業，興辦產業。
中央用國家政權的力量，透過各種政策手段和動用國庫資金，加緊推行資本原始的積累並以國營軍工企業為主導，仿照西方樣板力扶植資本主義發展。
為了更明確殖產興業大政方針，國務院特別制定了詔告全國的第一個“五年計劃”
一、逐步廢除各地厘金關卡養全國統一市場，交通部將大力建設鐵路，發展航運、郵政、電報等交通通訊事業。
二、對原有的工礦軍工企業加以改造和擴張形成國有的企業體系，並將大冶礦務局、上海武器製造局等建成所謂的“模範工廠”，以此來激勵全國。
三、全方位的引進西方先進技術和裝置，並引進各行各業的外國技術人才，對這些外聘人員，要給予高薪待遇，其薪金水平，將不得低於市長級別官員。
四、科技部將獎勵、保護、鼓勵優質新產品和新發明，儘可能多的邀請外國優秀企業來華舉辦各種形式的交流會、博覽會，以推廣他們的先進技術。
五、在農業方面，將引進西方農業技術、農業品種和經營管理制度，儘量使小規模的自耕農，能夠在五年之內，使其畝產量增長百分之二十以上。
六、扶持和保護私人財產，促進私人企業發展，各級政府應對民營企業採取保護措施，不得以任何理由打壓私人企業。
七、在不排斥外國
