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部隊裡有一個由特別班負責管理的動物飼養室。在這裡，飼養著兔子、豚鼠、老鼠和跳蚤。
原部隊人員一致強調，進行細菌戰著眼於老鼠和跳蚤，表現了指揮者石井四郎的惡魔&rdo;天才&ldo;。
石井中將一直把鼠疫和霍亂兩大菌種置於構成細菌戰基本內容的&rdo;兩大基本武器&ldo;的地位。大量製造鼠疫和霍亂兩大&rdo;武器&ldo;的特殊系統，就是根據石井式細菌培養法製造的。
為了利用製造出來的細菌進行細菌戰，需要有傳染的媒體。
鼠疫最有效的媒體就是跳蚤。飼養大量的跳蚤，利用細菌將它們汙染後，放到目的地去，短期間內就能夠使鼠疫蔓延開來。
&ldo;石井這老頭子和他的助手發現了透過將鼠疫菌寄生在跳蚤體內，使其在跳蚤的保護膜的保護下不斷繁殖的理想的迴圈途徑。這老頭子恐怕是世界上最精通跳蚤的專家，也是鼠疫菌的研究家&rdo;。這是一個原731部隊人員的證詞。
為了大量獲得被汙染了的跳蚤，就必須確保有大量的嚙齒類的動物（老鼠等）。
為了研究和實踐如何在短期內繁殖老鼠，731部隊紋盡了腦汁。
負責管理&ldo;馬魯太&rdo;的石井&ldo;特別班&rdo;，同時負責管理動物飼養室裡的跳蚤和老鼠。
在動物飼養室裡，有胖得像小狗那麼大的豚鼠。人們一走近它，它就瞪大眼睛發出尖叫聲。石井動物飼養室的老鼠，受到他們特別的愛護。
對731部隊來說，&ldo;馬魯太&rdo;是比較容易補充的&ldo;材料&rdo;，而卻不能讓老鼠輕易地死掉，因為它們是重要的&ldo;武器&rdo;。
出現幽靈的細菌工廠
第四部柄澤班負責管理的&ldo;口&rdo;字樓的一層，這是凝聚著731部隊的經驗和技術精華的大規模&ldo;細菌製造工廠&rdo;。
製造細菌的工序，是絕密中的絕密。柄澤班以外的部隊人員，除特別重要的事情以外，嚴禁進入&ldo;工廠&rdo;。
在一樓的後面，有一個鑲有瓷磚的消毒槽和更衣室。柄澤班成員首先更衣，必須&ldo;洗澡&rdo;之後才能到辦公室上班。在更衣室裡脫掉身上的全部衣服，換上白色工作服，帶上七、八層厚的紗布口罩和白色的帽子，以及一個從脖子直到腳尖的橡膠制的前圍裙，再穿上高到膝蓋下面的長膠靴子，還要帶上橡皮手套和特製的眼鏡才算裝備完畢。然後，以這身打扮走進浴室。浴室裡一個比較淺的浴池裡放滿了石炭酸溶液，他們嘩啦嘩啦地趟過消毒液才算結束。這時膝蓋以下部分變成了無菌狀態，這是一條消毒用的&ldo;小河&rdo;。
製造細菌的工序完全是、流水作業。走進&ldo;口&rdo;字樓一層，向左拐第一間就是細菌培養基室。在這裡放著四臺巨大的蒸汽鍋和培養基。在蒸汽鍋裡把瓊膠溶化以後，再放入培養基中，然後將它放入中央走廊右側的高壓鍋裡，高壓鍋的溫度高達180°c-250°c，使溶化了的瓊膠處於完全無菌狀態。
然後，把經過殺菌後的培養基瓊膠放進冷卻室內冷凍，再把形成的瓊膠培養基送進無菌室，在這裡把被培養的細菌塗在瓊膠上。
無菌室是一間約三十疊榻榻米大小的玻璃房間。部隊人員進入無菌室之前，必須首先透過&ldo;滅菌室&rdo;。從這個7平方米的&ldo;滅菌室&rdo;的天花板上噴出霧狀消毒液，給部隊人員全身消毒，以防止被培養的細菌以外的東西附著在瓊膠上。
向瓊膠植菌，是使用一根長五十公分的像鉛筆那樣粗的&l
