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納爾遜得到增援後向東繞過科西嘉島駛向義大利海岸，同時他為缺少快速帆船而惋惜。沒有快速帆船，搜尋和偵察都受到嚴重的影響。6月17日到達那不勒斯後，他獲悉法國人進攻了馬爾他。他從那兒繼續行進，取道最近的航線‐‐墨西拿海峽。
6月22日，納爾遜到達西西里島的科倫蒂島角。一艘雙桅船告訴他馬爾他已經陷落，法國艦隊已於16日再次啟航。這是一則帶來災難的錯誤訊息。如我們已提到的，那一天拿破崙仍在馬爾他，直到19日才啟航赴埃及。保持不變的西北風使納爾遜相信法國人唯一可能的目標是亞歷山大港，他立即確定了自己的航線。沒有笨重的運輸船妨礙，納爾遜預先做好了戰鬥準備，他將艦隊組成三個相平行的縱陣。他的原則是：啟航的命令應該是戰鬥的命令‐‐他後來把這寫進了有名的《特拉法爾加備忘錄》。兩個縱陣攻擊法國戰艦，第三縱陣追擊運輸船。
拿破崙幾乎以正東航向駛向克里特島南海岸，他想從那兒穿過地中海較窄的海面，然後沿著非洲海岸駛向亞歷山大。當納爾遜堅實的編隊和拿破崙密集的船隊以交會航向前進時，霧不合時令地越來越大。6月22日晚上，兩支艦隊航跡交會時實際也就相隔睛天時的目視距離。那天夜裡，布呂埃斯警覺地聽到了遠處英國人的訊號槍聲。
徑直航行的納爾遜於6月28日首先到達亞歷山大。看到港內沒有法國艦船，他痛苦地感到自己判斷錯了。依然想著拿破崙已於16日離開馬爾他，他難以相信自己超過了法國人6天時間。他煩躁不安，作出了不正確的舉動。幾乎沒有停留，就又啟航追尋敵人。幾小時之後，位於亞歷山大港外燈塔處的瞭望哨第一眼看見法國艦船從西邊駛來時，納爾遜的最後一艘艦正從北邊地平線上逝去。
拿破崙7月1日到達亞歷山大後，吃驚地從法國領事館得知納爾遜3天前曾到過那兒。在這種情況下，膽小的人可能撤退了，至少暫時會撤退，但拿破崙以他獨有的勇敢作出立即登陸的決定，全然不顧天色已晚，海面波濤洶湧。沿海岸西行幾海里後，運輸船開始放出小艇，布呂埃斯進行掩護。儘管有碰撞和觸礁的危險，那晚上大約4000名士兵掙扎到了海灘上，拿破崙率領他們連夜朝亞歷山大進軍。次日，攻陷亞歷山大，於是運輸船進入港口，而布呂埃斯的13艘戰艦和3艘快速帆船錨泊在該城東北約12海里處的阿布克灣深水區。
拿破崙留下3000法軍守衛亞歷山大，然後率領3萬人登上尼羅河西岸，一支攜帶給養和大炮的艦隊緊隨其後。3星期後，他到了開羅對面的一個差不多接近大金字塔的地方。在這兒，由1萬馬穆魯克騎兵和24萬名步兵排成輝煌的陣形，想阻止他們前進。面對埃及騎兵來勢兇猛的攻擊，法國人沒有立即開火，只等到距離很近時，步槍霰彈一齊射擊。排槍射擊打垮了馬穆魯克集團，拿破崙成了下埃及的主人。兩天後‐‐7月23日，他進入開羅。
此時，處於受挫和憂慮的痛苦之中的納爾遜正在地中海苦苦搜尋。從亞歷山大向北，他駛到小亞細亞沿岸。在那沒得到訊息，他又開始往西西里搜尋，於7月19日進入錫臘庫扎。當他知道法國人沒有進攻西西里或那不勒斯時，幾乎無法忍受的緊張感稍許得到了緩解，但他也只能得到這麼一點訊息。&ldo;只要他們在海上，我就要找到他們，&rdo;他堅定地說，&ldo;可能的話，迫使他們交戰。&rdo;納爾遜停留了幾天裝運給養，於25日再次啟程向東航行。在希臘附近他終於得到一則有用的訊息。4星期前曾有人在克里特島附近看見法國艦隊往東南航行。得到這一情報後，納爾遜立即確定航線駛向亞歷山大。
極度折磨納爾遜神經的歷時一月的搜尋並非浪費
