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個區域，每個區域都有一支守備部隊，人數大約在三萬以上
稱之為軍司，軍司之首稱之為軍司使，簡稱司使，每位司使下轄左右兩副使，稱為某域某軍司左使或右使。
十域軍司：
東域青龍軍司，主要防禦玉英山脈所覆蓋的區域。
南域朱雀軍司，主要防禦紫翠山脈所覆蓋的區域。
西域白虎軍司，主要防禦碧玉山脈所覆蓋的區域。
北域玄武軍司，主要防禦瓊華山脈所覆蓋的區域。
上域昊天軍司，主要防禦天墉山脈所覆蓋的區域。
下域九幽軍司，主要防禦鈺門山脈所覆蓋的區域。
前域長生軍司，主要防禦閬風山脈所覆蓋的區域。
後域輪迴軍司，主要防禦懸圃山脈所覆蓋的區域。
中域麒麟軍司，主要防禦玉山主峰崑崙宮，是拱衛主峰的中央軍司，總人數在五萬左右。
異域神獰軍司，並沒有固定的防衛區域，是十域軍司之中數量最多，裝備最強，唯一支機動軍司，直屬玉山王母、左玄女、右青鸞三人，總人數在六萬左右。
十域軍司總人數在四十萬左右。
與軍司對應的就是祭壇，一共有十二個祭壇，祭壇下轄左右兩分舵，共二十四分舵，分舵名稱按所在總壇分，例如某祭壇則左舵或右舵。
在舵以下就是堂，每個舵下轄十至二十個堂，堂的數量並非固定，主要隨管轄區域變化而變化，目前玉山宗共有三百六十五個堂。每個堂管轄的區域以及戶數都是不固定的，基本在千戶左右，十二祭壇大約管轄五十萬戶左右。
祭壇之首稱為祭壇主，簡稱壇主，祭壇主的地位與軍司使相當，只是職能不一樣而已，一個是文，一個是武。舵之首稱左右舵主地位與軍司左右副使相當，堂之首稱堂主。
十二祭壇以天地玄黃洪荒宇宙日月星辰加十二地支命名。
天子祭壇與地醜祭壇直屬於崑崙宮，總壇設在玉山主峰之肩下，也就是玉山宗門左右兩側，其作用是協助宗門管理日常事務。
玄寅祭壇和黃卯祭壇的總壇設在了玉山之外，玄寅祭壇設在清水鎮附近，黃卯祭壇設在了青丘附近，這兩個祭壇的主要作用就是監管中原和東南各荒以及統領這些地方的所有玉山勢力。
洪辰壇總壇設在玉英殿之下，其作用是協助玉英殿主，管理玉英一脈的日常事務。
荒巳壇總壇設在紫翠殿之下，其作用是協助玉英殿主，管理玉英一脈的日常事務。
宇午壇總壇設在碧玉殿之下，其作用是協助碧玉殿主，管理碧玉一脈的日常事務。
宙未壇總壇設在瓊華殿之下，其作用是協助瓊華殿主，管理瓊華一脈的日常事務。
日申壇總壇設在閬風殿之下，其作用是協助閬風殿主，管理閬風一脈的日常事務。
月酉壇總壇設在天墉殿之下，其作用是協助天墉殿主，管理天墉一脈的日常事務。
星戌壇總壇設在鈺門殿之下，其作用是協助鈺門殿主，管理鈺門一脈的日常事務。
辰亥壇總壇設在懸圃殿之下，其作用是協助懸圃殿主，管理懸圃一脈的日常事務。
十二祭壇除了主峰直屬與特殊作用四壇以外，其餘八壇與對應八脈。都屬於從屬關係，就是類似於玉山宗與崑崙宮之間的關係，雖然是從屬關係，但本質上並沒有高低之分，只是責任不一樣，八脈殿主專司祭祀與守護（主要是守護輔助法陣與脈眼），八位壇主專司各脈範圍內的日常事務。
在軍司與祭壇以外，還有一個特殊機構，那就是衛隊，從性質上與軍司類似，但實質上還包含了祭壇的部分職能。用通俗的話來解釋，軍司是守護整個玉山區域的核心防衛力量，也是對外
