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百花仙子在武家集住了下來，開始教授葉天行和武妙涵醫藥學。為了便於治療葉清源和教導葉天行，她搬到葉家居住，上官百合和武妙涵也隨她搬了過來，葉家的院子大，客房也多，倒是不愁住的地方。
研修醫藥學，先從識藥開始，而後識體，最後是醫術和煉丹。為此，明光將後花園開闢成一塊五畝大小的藥田，雖說藥田不大，但一些常見藥草基本都種齊全，以便葉天行二人辨識藥草。百花仙子還經常前往南荒古林，採集些珍稀高階藥草來，來加強二人的識藥能力。
至於識體，百花仙子身為得道之人，內在修為自是不凡，她從最初的五行經絡教起，葉天行將百花仙子所教與先前所學的《五行總訣》兩相印證，因此他學起來，如魚得水，自然事半功倍，獲益匪淺，從而極大地加深了他對自然萬物衍生變化的感悟能力，為進一步修習《五靈飛天訣》，開啟了方便之門。
項鍊內所藏的《五靈飛天訣》，不知為何人所創。此訣蘊含天地衍生至理，共分《五靈衍生》和《築基訣要》兩部分。它強調天地萬物皆為五行之氣所化，修仙實際上就是人與天爭，而人的力量非常渺小，只有將天地靈氣化為五靈之氣，才能將天地之力吸納入體，為人所用，從而擺脫生命法則的桎梏。可若想將天地靈氣煉化為可用的五靈之氣，首要就是體悟五靈衍生，在人的丹田內拓出五靈靈氣旋渦，積累五靈之氣，稱之為練氣，五靈靈氣旋渦盈滿液化即為築基成功，從而跨入先天境。此後即可透過吸收煉化天地靈氣溫養自身，延緩其衰竭，最終證得五靈大道而飛昇，成仙成聖。
具體的道階劃分為：練氣，也稱準備期；築基、金丹、元嬰、出竅、分神、合體、洞虛、大乘、渡劫，也稱人界修仙九大階；天仙、大羅金仙、位仙、仙聖，也稱仙界修仙四大階。魔修也相對應劃分為凝元、魔丹、魔嬰、化形、離識、合體、洞虛、大乘、渡劫、天魔、羅天真魔丶魔羅王和魔尊。
《五靈飛天訣》對五靈築基極為看重，認為它是修者在人界修行的至為關鍵的一步，是凡人踏上仙途的基石，為此特意在《五靈衍生》部分給出了一種《五靈吐納法》，並輔以內視術、斂氣術等小神通，以便在練氣階段，可透過五靈吐納之法吸收少量的天地靈氣，為築基打下基礎，而內視術則可以幫助修行者觀察體內的靈力迴圈，更好地體會天地靈氣轉化為五靈之氣的衍生變化。
然而，練氣畢竟屬於為五靈築基打基礎的階段，吐納一個周天，只能吸收煉化少量的天地靈氣，進度較慢，但《五靈飛天訣》講求厚積薄發，前期緩慢而後勁十足。
《五靈吐納法》強調，人之呼吸不止，則吐納不止，師法自然。無定法，無程式，因人而異。須將練氣吐納融入日常生活，坐臥行走，無不為之。也就是要求呼吸吐納成為修者的一種本能行為，就像人在睡夢中也能呼吸一樣。同時，著重強調體悟“靜”之境，“靜”為學問之始，正所謂寧靜以致遠，心靜則氣歸，無靜則萬念叢生，功無所行。
一年後，葉天行已由初時的夜靜練功之“靜中取靜”，逐漸達到了於日常生活中呼吸吐納之“鬧中取靜”的境界，練功達到了不著相於言、聽、視、行、住、坐、臥等日常生活行為。
《五靈飛天訣》本質上是屬於築道基的大道法訣，所吸收煉化的天地靈氣是一種源自宇宙的奇異力量，煉化為五靈之氣後可藏在修煉者的經脈穴位內，成為蓄勢待發之無窮無盡的強大力量。為了充分發揮其能力，強調氣、體、心同修，為此它又特意給出了一種《五靈煉體術》，特別強調要感悟生命法則，能調動天地靈氣，化自然萬物為我所用，能以天地之氣護身驅毒、生肌止血、延年益壽。
《五靈煉體術》將煉體階段劃分為：後天境，也稱準備期；先天境、重生境、煉嬰境、通臂境、法
